Белки

Значение изоэлектрической точки является характерной константой белков. Белки с pI меньше 7 называются кислотными, а белки с pI больше 7 —  основными. В целом, pI белка зависит  от выполняемой им функции: изоэлектрическая точка большинства белков тканей позвоночных лежит в пределах от 5,5 до 7,0, однако в некоторых случаях  значения лежат в экстремальных  областях: так, например, для пепсина  — протеолитического фермента сильнокислого  желудочного сока pI ~ 1[9], а для  сальмина — белка-протамина молок  лосося, особенностью которого является чрезвычайно высокое содержание аргинина, pI ~ 12. Белки, связывающиеся  с нуклеиновыми кислотами за счёт электростатического взаимодействия с фосфатными остатками нуклеиновых  кислот, часто являются основными  белками. Примером таких белков служат гистоны и протамины.

Белки различаются по степени  растворимости в воде, но большинство  белков в ней растворяются. К нерастворимым  относятся, например, кератин (белок, из которого состоят волосы, шерсть млекопитающих, перья птиц и т. п.) и фиброин, который  входит в состав шёлка и паутины. Белки также делятся на гидрофильные и гидрофобные. К гидрофильным относятся  большинство белков цитоплазмы, ядра и межклеточного вещества, в том  числе нерастворимые кератин  и фиброин. К гидрофобным относятся  большинство белков, входящих в состав биологических мембран интегральных мембранных белков, которые взаимодействуют  с гидрофобными липидами мембраны[10] (у этих белков обычно есть и небольшие  гидрофильные участки).

 

 

 

 

 

 

Функции белков в  клетке.

Белки служат теми инструментами, посредством которых генетическая информация получает свое реальное воплощение. В соответствии с тем, что в  клеточном ядре содержатся тысячи генов, каждый из которых определяет какой-то один характерный признак живого организма, в клетке существуют тысячи  белков и каждый из них выполняет  специфическую функцию.

Самый многообразный и  наиболее высокоспециализированный класс  белков, выполняющий важнейшую биологическую  функцию - создание точно и гибко  координированной системы целенаправленных взаимозависимых химических реакций, в результате совместного протекания которых возникает "жизнь" - это  ферменты, функцией которых является управляемый катализ большого числа химических реакций, в которых участвуют как низко-, так и высокомолекулярные субстраты.

Транспортные белки - белки, которые выполняют функцию транспорта специфически связывают и переносят те или другие молекулы и ионы через мембраны клеток (как внутрь клетки, так и во вне), а также от одного органа организма к другому.  Гемоглобин, содержащийся в эритроцитах, при прохождении крови через легкие связывает кислород и доставляет его к периферическим тканям, где кислород высвобождается и используется для окисления компонентов пищи - процесса в ходе которого производится энергия. Плазма крови содержит  липопротеины, осуществляющие перенос липидов из печени в другие органы. В клеточных мембранах присутствует типы транспортных белков, способных связывать  глюкозу,  аминокислоты и переносить их внутрь клеток.

Пищевые и запасные белки - белки, которые выполняют функцию  обеспечения питанием зародышей  растений и животных на первых стадиях  их развития.

Наиболее известными примерами  таких белков служат белки семян  пшеницы, кукурузы и риса. К пищевым  белкам относится яичный  альбумин - основной компонент яичного белка, и  казеин, главный белок молока. В ферритине, встречающимся в животных тканях, запасено железо.

Сократительные и двигательные белки - белки, которые обеспечивают клетку или организм двигательной функцией,- способностью сокращаться, изменять форму и передвигаться.

Белками с такой функцией являются  актин и  миозин, представляющие собой нитевидные белки, функционирующие в сократительной системе скелетной мышцы, а также во многих немышечных тканях (микрофиламенты эукариотических клеток). Другим примером таких белков служит  тубулин  - белок из которого построены  микротрубочки, являющиеся важными элементами ресничек и жгутиков, при помощи которых клетки передвигаются. Длинные клетки нервной системы животных также содержат микротрубочки.

 Структурные белки  - белки образующие волокна, навитые  друг на друга или уложенные  плоским слоем, выполняют опорную  или защитную функцию, скрепляют  между собой биологические структуры  организмов и придают им прочность. 

Главным компонентом хрящей и сухожилий является фибриллярный белок коллаген, имеющий очень высокую прочность на разрыв. Связки содержат  эластин - структурный белок способный растягиваться в двух измерениях. Волосы ногти и перья состоят почти исключительно из прочного нерастворимого белка кератина. Главным компонентом шелковых нитей и паутины служит белок  фиброин.

Защитные белки выполняют  функцию защиты организма от вторжения  других организмов или предохранения  его от повреждений. Эту функцию выполняют  иммуноглобулины (или  антитела), образующиеся у позвоночных, обладающие способностью распознавать чужеродные клетки,- проникшие в организм бактерии или вирусы или клетки самого организма, переродившиеся в раковые,- а также чужеродные для организма белки, и прочно связываться с ними. Аналогичная защитная функция у фибриногена и тромбина - белков, участвующих в процессе свертывания крови; они предохраняют организм от потери крови при повреждении сосудистой системы.

Белки змеиного яда,  бактериальные токсины и токсичные белки растений, например,  рицин, вероятно, также в определенном смысле можно отнести к белкам, выполняющим защитную функцию.

Регуляторные белки имеют  функцию регуляции клеточной  или физиологической активности. К регуляторным белкам относятся  многие  гормоны, такие как  инсулин, регулирующий обмен глюкозы,  гормон роста, синтезируемый в гипофизе,  паратиреоидный гормон, регулирующий  транспорт ионов кальция и фосфатов и др.

Регуляторные белки, называемые  репрессорами, функционируют как регуляторы биосинтеза  ферментов в бактериальных клетках.

Имеется много других белков, функции которых уникальны, что  затрудняет их классификацию:

Так, например,  монеллин - белок, содержащийся в одном из африканских растений, имеет очень  сладкий вкус. Он стал предметом  изучения как нетоксичное и не способствующее ожирению вещество, которое  может быть использовано вместо сахара. Плазма крови некоторых антарктических рыб содержит белки со свойствами антифриза, предохраняющие кровь этих рыб от замерзания. Шарниры в местах прикрепления крыльев у ряда насекомых  состоят из белка  резилина, обладающего почти идеальной эластичностью.

 

 

 

 

 

 

 

 

Синтез белка  в клетке.

Совокупность реакций  биологического синтеза называется пластическим обменом, или ассимиляцией. Название этого вида обмена отражает его сущность: из простых веществ, поступающих в клетку извне, образуются вещества, подобные веществам клетки.

Рассмотрим одну из важнейших  форм пластического обмена – биосинтез  белков. Все многообразие свойств  белков в конечном счете определяется первичной структурой, т. е. последовательностью  аминокислот. Огромное количество отобранных эволюцией уникальных сочетаний  аминокислот воспроизводится путем  синтеза нуклеиновых кислот с  такой последовательностью азотистых  оснований, которая соответствует  последовательности аминокислот в  белках. Каждой аминокислоте в полипептидной  цепочке соответствует комбинация из трех нуклеотидов – триплет.

Процесс реализации наследственной информации в биосинтезе осуществляется при участии трех видов рибонуклеиновых  кислот: информационной (матричной) –  иРНК (мРНК), рибосомальной – рРНК и транспортной – тРНК. Все рибонуклеиновые  кислоты синтезируются на соответствующих  участках молекулы ДНК. Они имеют  значительно меньшие размеры, чем  ДНК, и представляют собой одинарную  цепь нуклеотидов. Нуклеотиды содержат остаток фосфорной кислоты (фосфат), пентозный сахар (рибозу) и одно из четырех азотистых оснований  – аденин, цитозин, гуанин и урацил. Азотистое основание – урацил – комплементарно аденину.

Процесс биосинтеза сложный  и включает ряд этапов – транскрипцию, сплайсинг и трансляцию.

Первый этап (транскрипция) происходит в ядре клетки: на участке  определенного гена молекулы ДНК  синтезируется мРНК. Этот синтез осуществляется при участии комплекса ферментов, главным из которых является ДНК-зависимая  РНК-полимераза, которая прикрепляется  к начальной (инициальной) точке  молекулы ДНК, расплетает двойную спираль  и, перемещаясь вдоль одной из нитей, синтезирует рядом с ней  комплементарную нить мРНК. В результате транскрипции мРНК содержит генетическую информацию в виде последовательного чередования нуклеотидов, порядок которых точно скопирован с соответствующего участка (гена) молекулы ДНК.

Дальнейшие исследования показали, что в процессе транскрипции синтезируется так называемая про-мРНК – предшественник зрелой мРНК, участвующей  в трансляции. Про-мРНК имеет значительно  большие размеры и содержит фрагменты, не кодирующие синтез соответствующей  полипептидной цепи. В ДНК наряду с участками, кодирующими рРНК, тРНК и полипептиды, имеются фрагменты, не содержащие генетической информации. Они получили название интронов в  отличие от кодирующих фрагментов, которые называются экзонами. Интроны  обнаружены на многих участках молекул  ДНК. Так, например, в одном гене –  участке ДНК, кодирующем овальбумин курицы, содержится 7 интронов, в гене сывороточного альбумина крысы  – 13 интронов. Длина интрона бывает различной – от двухсот до тысячи пар нуклеотидов ДНК. Интроны  считываются (транскрибируются) одновременно с экзонами, поэтому про-мРНК значительно  длиннее, чем зрелая мРНК. В ядре в про-мРНК специальными ферментами вырезаются интроны, а фрагменты  экзона «сращиваются» между собой  в строгом порядке. Этот процесс  называют сплайсингом. В процессе сплайсинга образуется зрелая мРНК, которая содержит только ту информацию, которая необходима для синтеза соответствующего полипептида, то есть информативную часть структурного гена.

Значение и функции  интронов до сих пор еще не совсем выяснены, но установлено, что, если в  ДНК считываются только участки  экзонов, зрелая мРНК не образуется. Процесс  сплайсинга изучен на примере работы гена овальбумина. Он содержит один экзон  и 7 интронов. Сначала на ДНК синтезируется  про-мРНК, содержащая 7700 нуклеотидов. Затем  в про-мРНК число нуклеотидов  уменьшается до 6800, затем - до 5600, 4850, 3800, 3400 и т. д. до 1372 нуклеотидов, соответствующих  экзону. Содержащая 1372 нуклеотида мРНК выходит из ядра в цитоплазму, попадает на рибосому и синтезирует соответствующий  полипептид.

Следующий этап биосинтеза – трансляция – происходит в  цитоплазме на рибосомах при участии  тРНК.

Транспортные РНК синтезируются  в ядре, но функционируют в свободном  состоянии в цитоплазме клетки. Одна молекула тРНК содержит 76-85 нуклеотидов  и имеет довольно сложную структуру, напоминающую клеверный лист. Три  участка тРНК имеют особо важное значение: 1) антикодон, состоящий из трех нуклеотидов, определяющий место  прикрепления тРНК к соответствующему комплементарному кодону (мРНК) на рибосоме; 2) участок, определяющий специфичность  тРНК, способность данной молекулы прикрепляться только к определенной аминокислоте; 3) акцепторный участок, к которому прикрепляется аминокислота. Он одинаков для всех тРНК и состоит  из трех нуклеотидов – Ц-Ц-А. Присоединению  аминокислоты к тРНК предшествует ее активация ферментом аминоацил-тРНК-синтетазой. Этот фермент специфичен для каждой аминокислоты. Активированная аминокислота прикрепляется к соответствующей  тРНК и доставляется ею на рибосому.

Центральное место в трансляции принадлежит рибосомам – рибонуклеопротеиновым  органоидам цитоплазмы, во множестве  в ней присутствующим. Размеры  рибосом у прокариот в среднем 30х30х20 нм, у эукариот – 40х40х20 нм. Обычно их размеры определяют в единицах седиментации (S) – скорости осаждения при центрифугировании в соответствующей среде. У бактерии кишечной палочки рибосома имеет величину 70 S и состоит из двух субчастиц, одна из которых имеет константу 30 S, вторая 50 S, и содержит 64 % рибосомальной РНК и 36 % белка.

Молекула мРНК выходит  из ядра в цитоплазму и прикрепляется  к малой субчастице рибосомы. Трансляция начинается с так называемого  стартового кодона (инициатора синтеза) – А-У-Г-. Когда тРНК доставляет к  рибосоме активированную аминокислоту, ее антикодон соединяется водородными  связями с нуклеотидами комплементарного кодона мРНК. Акцепторный конец тРНК с соответствующей аминокислотой  прикрепляется к поверхности  большой субчастицы рибосомы. После  первой аминокислоты другая тРНК доставляет следующую аминокислоту, и таким  образом на рибосоме синтезируется  полипептидная цепь. Молекула мРНК обычно работает сразу на нескольких (5-20) рибосомах, соединенных в полисомы. Начало синтеза полипептидной цепи называют инициацией, рост ее – элонгацией. Последовательность аминокислот в полипептидной цепи определяется последовательностью кодонов в мРНК. Синтез полипептидной цепи прекращается, когда на мРНК появляется один из кодонов-терминаторов – УАА, УАГ или УГА. Окончание синтеза данной полипептидной цепи называется терминацией.

Установлено, что в клетках  животных полипептидная цепь за одну секунду удлиняется на 7 аминокислот, а мРНК продвигается на рибосоме на 21 нуклеотид. У бактерий этот процесс  протекает в два-три раза быстрее.

Следовательно, синтез первичной  структуры белковой молекулы – полипептидной  цепи – происходит на рибосоме в  соответствии с порядком чередования  нуклеотидов в матричной рибонуклеиновой  кислоте – мРНК. Она не зависит  от строения рибосомы.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Всасывание аминокислот.

Основным механизмом поступления  аминокислот в энтероцит является Nа⁺-зависимый активный транспорт. Вместе с тем возможна и диффузия аминокислот по электрохимическому градиенту. Наличием двух механизмов транспорта объясняют тот факт, что D-аминокислоты всасываются быстрее (за счет активного транспорта), чем L-изомеры, поступающие в клетку пассивно, путем диффузии. У взрослых животных диффузия, очевидно, происходит лишь при нарушении механизма активного транспорта. В нормальных же условиях поступление аминокислот в энтероцит обеспечивается механизмами облегченной диффузии и активного транспорта, реализующимися с участием переносчиков. Предполагают наличие различных транспортных систем для нейтральных, основных, N-замещенных и дикарбоновых аминокислот.